Sono passati tre anni dalla sconfitta di Malomyotismon. Tai è ora diciassettenne e frequenta il liceo, ma lui e gli altri prescelti, ad eccezione di Matt e Sora, ultimamente si sono un po’ persi di vista. In città cominciano a verificarsi strani blackout e problemi alle linee telefoniche, e un giorno, un Kuwagamon compare dal nulla iniziando a seminare il panico per tutta Odaiba. Tai, tentando di salvare i civili, finisce nei guai, ma  all’ultimo momento, Agumon giunge in suo aiuto, digievolvendo in Greymon e dando vita ad un acceso conflitto. Sarà questo che costringerà i digiprescelti a riunirsi e decidere cosa fare: combattere rischiando di distruggere il loro mondo o arrendersi?